Benoît Brunet naît le 22 juillet 1991 à Tourcoing. À l’âge de 16 ans, il s’initie à la pratique de l’aviron au club de l’Aviron Boulonnais avant de rejoindre celui de Saint-Quentin en 2017. Rapidement performant, il intègre le Pôle France et Espoirs Aviron de Nancy. Il participe, dès 2009, à ses premiers championnats du monde avec l’équipe de France juniors.

Aligné en deux de pointe en compagnie de Sébastien Lenté entre 2011 et 2014, il s’illustre cependant davantage dans la catégorie du huit de pointe. Régulièrement convié en équipe de France, il remporte ainsi le titre de vice-champion du monde universitaire en 2016, à Poznan en Pologne.

Depuis le mois de décembre de cette même année, Benoît Brunet fait partie du dispositif Athlètes SNCF.

Médaillé de bronze en quatre de point sans barreur (M4-) aux championnats d’Europe 2023, Benoît Brunet est désigné meilleur rameur 2023 par l’Association des Internationaux d’Aviron. De nouveau « bronzé » avec l’équipe de France, en avril 2024, aux championnats d’Europe de Szeged, en Hongrie, Benoît Brunet est sélectionné par la Fédération française d’Aviron pour intégrer l’équipage du quatre sans barreur aux Jeux Olympiques de Paris 2024.