À la tête de SNCF de 1996 à 2006, Louis Gallois donne une impulsion nouvelle à l’entreprise. Réseau Ferré de France (RFF) est créé en 1997. Transilien est lancé en 1999 pour incarner le renouveau des transports régionaux en Île-de-France. En 2000, les régions prennent le rôle d’autorités organisatrices de transport. En 2001, SNCF met en ligne ce qui va devenir le premier site de e-commerce en France : Voyages-sncf.com. Enfin, la ligne TGV Méditerranée rapproche Marseille de Paris et iDTGV renouvelle la façon de voyager.