Diplômé de l’École Centrale de Lyon ainsi que d’un master de management et de logistique de l’Essec, il s’occupe, de 2002 à 2004, de la coordination du plan de restructuration du Fret. Il devient directeur de la la gare de Paris Nord de 2005 à 2007, puis directeur de cabinet du président de SNCF en 2007. Il travaille successivement avec Anne-Marie Idrac et Guillaume Pepy. De 2008 à 2012, il est directeur des lignes D et R du RER et directeur de la région Paris Sud-Est. En 2012, Alain Krakovitch exerce les fonctions de directeur général Sécurité et Qualité de Service Ferroviaire, avant de devenir directeur de Transilien en 2014.

Nommé directeur de TGV-Intercités en 2020, Alain Krakovitch a notamment permis à l’activité TGV-INTERCITÉS de répondre à une demande en forte croissance grâce à sa performance industrielle et son excellence opérationnelle, la création de nouvelles offres commerciales et le développement réussi des marchés européens.

Il est nommé le 18 mai directeur du Matériel, puis Directeur général adjoint de SNCF Voyageurs en juillet 2026.